論文情報 - Materials and Methodsの記載例 -
論文を読んだ研究者が同じ内容の研究を反復できるかどうか、いわゆる学術論文の「再現性」は、その論文の信頼性に直結する非常に重要な事柄です。Materials and Methodsは、論文の再現性を主張するために重要なパートであり、読者が研究を反復できるように十分な情報を記載する必要があります。
ここでは、当社のオールインワン蛍光顕微鏡を使用機器としてMaterials and Methodsに記載いただく場合の、各種機能等の名称や表記方法、具体的な文章例をご紹介いたします。論文を執筆される際の参考になれば幸いです。
個別の表記方法
使用機器について記載する場合、一般的には、機器名、型式名、メーカー情報（メーカー名、所在地）などを明記します。また、オプションアプリケーションなど、標準でない機能等を利用した場合は、その機能名、型式名等を加えます。 また、顕微鏡観察においては対物レンズに関する記載も重要な要素の一つです。倍率や開口数（N.A.）が表記されていることは多いですが、メーカーによって設計思想が異なるため、同じ倍率でも実は視野が異なるということも少なくありません。また、波長ごとの透過率など、光学特性が異なることも多いため、製造メーカー名などの情報を加えることが望ましいと言えます。同様に、蛍光観察においては蛍光フィルタの波長域の記載も重要です。
例① オールインワン蛍光顕微鏡 BZ-X800の表記例
All-in-one fluorescence microscope (BZ-X800, KEYENCE, Osaka, Japan)
| 商品名 | 型式 | メーカー名 | メーカー所在地 |
|---|---|---|---|
| All-in-one fluorescence microscope | BZ-X800 | KEYENCE | Osaka, Japan |
個別名称
| 型式 | 商品名（和文） | 商品名（英文） | |
|---|---|---|---|
| BZ-X800（BZ-X700） | オールインワン蛍光顕微鏡 | All-in-one Fluorescence Microscope | ▼具体例 |
| BZ-H4XD（BZ-H3XD） | マルチスタックモジュール | Advanced Observation Module | ▼具体例 |
| BZ-H4XF（BZ-H3XF） | セクショニングモジュール | Sectioning Module | ▼具体例 |
| BZ-H4XI（BZ-H3XI） | イメージサイトメーターモジュール | Image Cytometer Module | ▼具体例 |
| BZ-H4XT（BZ-H3XT） | タイムラプスモジュール | Time-lapse Module | ▼具体例 |
| BZ-H4A（BZ-H3A） | 解析アプリケーション | BZ-X Analyzer software | |
| BZ-H4C（BZ-H3C） | ハイブリッドセルカウント | Hybrid Cell Count Application | ▼具体例 |
| BZ-H4R（BZ-H3R） | 3D解析アプリケーション | 3D Application | ▼具体例 |
| BZ-H4K | 動態解析アプリケーション | Motion Analysis Application | ▼具体例 |
| BZ-H4M（BZ-H3M） | 計測アプリケーション | Measurement Application |
例② プランアポクロマートレンズ 40倍 BZ-PA40の表記例
Plan Apochromat 40x objective(NA0.95, BZ-PA40, KEYENCE, Osaka, Japan)
| 商品名 | N.A. | 型式 | メーカー名 | メーカー所在地 |
|---|---|---|---|---|
| Plan Apochromat 40x objective | NA0.95 | BZ-PA40 | KEYENCE | Osaka, Japan |
個別名称
| 型式① | 商品名① | 型式② | 商品名② | 開口数（NA） | その他 | |
|---|---|---|---|---|---|---|
| BZ-PA02 | Plan Apochromat 2x | 972029 | CFI Plan Apo λ2x | 0.10 | ▼具体例 | |
| BZ-PA04 | Plan Apochromat 4x | 972030 | CFI Plan Apo λ4x | 0.20 | ||
| BZ-PA10 | Plan Apochromat 10x | 972031 | CFI Plan Apo λ10x | 0.45 | ||
| BZ-PA20 | Plan Apochromat 20x | 972032 | CFI Plan Apo λ20x | 0.75 | ||
| BZ-PA40 | Plan Apochromat 40x | 972033 | CFI Plan Apo λ40x | 0.95 | ||
| BZ-PA60 | Plan Apochromat 60x | 972036 | CFI Plan Apo λ60xH | 1.40 | 液浸（Oil） | |
| BZ-PA100 | Plan Apochromat 100x | 972037 | CFI Plan Apo λ100xH | 1.45 | 液浸（Oil） | |
| BZ-PF04P | Plan Fluorite 4x PH | 972081 | CFI Plan Fluor DL 4x | 0.13 | 位相差 | |
| BZ-PF10P | Plan Fluorite 10x PH | 971936 | CFI Plan Fluor DL 10x | 0.30 | 位相差 | |
| BZ-PF20LP | Plan Fluorite 20x LD PH | 971962 | S PL FL ELWD ADM 20xC | 0.45 | 位相差 | |
| BZ-PF40LP | Plan Fluorite 40x LD PH | 971963 | S PL FL ELWD ADM 40xC | 0.60 | 位相差 |
例③ GFPフィルターの表記例
GFP filter (ex: 470/40nm, em: 525/50nm, dichroic: 495nm, OP-87763, KEYENCE, Osaka, Japan)
| 商品名 | 波長特性 | 型式 | メーカー名 | メーカー所在地 |
|---|---|---|---|---|
| GFP filter | ex: 470/40nm, em: 525/50nm, dichroic: 495nm | OP-87763 | KEYENCE | Osaka, Japan |
個別名称
| 型式 | 商品名 | 励起波長（Ex） | 吸収波長（Em） | ダイクロイックミラー波長 （dichroic） |
|
|---|---|---|---|---|---|
| OP-87762 | DAPI filter | 360/40 nm | 460/50 nm | 400 nm | ▼具体例 |
| OP-88359 | DAPI-V filter | 395/25 nm | 460/50 nm | 425 nm | |
| OP-87763 | GFP filter | 470/40 nm | 525/50 nm | 495 nm | |
| OP-87764 | TRITC filter | 545/25 nm | 605/70 nm | 565 nm | |
| OP-87765 | TexasRed filter | 560/40 nm | 630/75 nm | 585 nm | |
| OP-87766 | Cy5 filter | 620/60 nm | 700/75 nm | 660 nm |
具体的な記載例
BZ-X800
HE染色した切片の画像はすべて、オールインワン蛍光顕微鏡BZ-X800を使って、プランアポクロマート20倍（BZ-PA20）で取得しました。
All images of the Hematoxylin and Eosin stained sections were obtained with an all-in-one fluorescence microscope (BZ-X800, KEYENCE, Osaka, Japan) using a Plan Apochromat 20x objective （NA0.75, BZ-PA20, KEYENCE, Osaka, Japan).
画像はプランアポクロマート40倍（BZ-PA40）を備えたオールインワン蛍光顕微鏡BZ-X800で撮影しました。赤色の蛍光は、TexasRedフィルター（OP-87765）を使って検出しました。
The images were obtained with an all-in-one fluorescence microscope (BZ-X800, KEYENCE, Osaka, Japan) equipped with a Plan Apochromat 40x objective （NA0.95, BZ-PA40, KEYENCE, Osaka, Japan). Red fluorescence was detected using a TexasRed filter (ex:560/40nm, em:630/75nm, dichroic:585nm, OP-87765, KEYENCE, Osaka, Japan).
BZ-H4XD
フラットマウント全体のイメージングには、マルチスタックモジュール（BZ-H4XD）とプランアポクロマート10倍レンズ（BZ-PA10）を搭載したオールインワン蛍光顕微鏡BZ-X800を使ってタイル状の画像を撮影し、画像のつなぎあわせにはBZ-X解析ソフトウェア（BZ-H4A）の画像連結機能を用いました。
For imaging of the entire flat mount, an all-in-one fluorescence microscope (BZ-X800, KEYENCE, Osaka, Japan) equipped with an advanced observation module (BZH4XD, KEYENCE, Osaka, Japan) and a Plan Apochromat 10x objective (NA0.45, BZ-PA10, KEYENCE, Osaka, Japan) was used to capture tiled images, and the image stitching function in the BZ-X Analyzer software (BZ-H4A, KEYENCE, Osaka, Japan) was used for image stitching.
BZ-H4XF
細胞の断面像は、光学セクショニングモジュール（BZ-H4XF）を搭載したオールインワン蛍光顕微鏡（BZ-X800）で撮影しました。
The cross-section images of cells obtained by using an all-in-one fluorescence microscope (BZ-X800, KEYENCE, Osaka, Japan) equipped with an optical sectioning module (BZ-H4XF, KEYENCE, Osaka, Japan).
BZ-H4XI
ヘキスト陽性細胞は、イメージサイトメーターモジュール（BZ-H4XI）を搭載したオールインワン蛍光顕微鏡（BZ-X800）で定量的に評価しました。
Hoechst33342 positive cells were quantitatively evaluated using an all-in-one fluorescence microscope (BZ-X800, KEYENCE, Osaka, Japan) equipped with an image cytometer module (BZ-H4XI, KEYENCE, Osaka, Japan).
BZ-H4XT
感染挙動の画像は、タイムラプスモジュール（BZ-H4XT）とステージトップチャンバー及びCO2ガス混合器搭載の温度コントローラー（INUG2-KIW、東海ヒット）を備えたオールインワン蛍光顕微鏡（BZ-X800）で、37℃、CO2濃度5％の環境下で撮影しました。
Images of infection behavior were taken under an all-in-one fluorescence microscope (BZ-X800, KEYENCE, Osaka, Japan) equipped with a time-lapse module (BZ-H4XT, KEYENCE, Osaka, Japan) and a stage-top chamber and temperature controller with built-in CO2 gas mixer (INUG2-KIW, Tokai hit, Shizuoka, Japan) at 37°C and 5% CO2.
BZ-H4C
陽性領域の面積とシグナル強度は、BZ-X解析ソフトウェア（BZ-H4A）のハイブリッドセルカウントアプリケーション（BZ-H4C）を用いて自動計算しました。
Positive areas and signaling intensities were automatically calculated using a hybrid cell count application (BZ-H4C, KEYENCE, Osaka, Japan) in the BZ-X Analyzer software (BZ-H4A, KEYENCE, Osaka, Japan).
各群からランダムに5枚の画像を選択し、 BZ-X解析ソフトウェア（BZ-H4A）のハイブリッドセルカウントアプリケーション（BZ-H4C）を用いて、画像ごとの心筋線維化率を自動的に定量化しました。
Five images were randomly chosen from each group and the percentage of myocardial fibrosis per image was automatically quantified using a hybrid cell count application (BZ-H4C, KEYENCE, Osaka, Japan) in the BZ-X Analyzer software (BZ-H4A, KEYENCE, Osaka, Japan).
BZ-H4R
スフェロイドはオールインワン蛍光顕微鏡（BZ-X800）でZスタック撮影し、BZ-X解析ソフトウェア（BZ-H4A）の3Dアプリケーション（BZ-H4R）を使ってZ投影画像を解析しました。
Spheroids were imaged as a Z-stack under an all-in-one fluorescence microscope (BZ-X800, KEYENCE, Osaka, Japan) and Z-projection images analyzed using a 3D application (BZ-H4R, KEYENCE, Osaka, Japan) within the BZ-X Analyzer software (BZ-H4A, KEYENCE, Osaka, Japan).
BZ-H4K
BZ-X解析ソフトウェア（BZ-H4A）の動態解析アプリケーション（BZ-H4K）を使って、細胞をトラッキングし、移動速度と蛍光強度の変化量の療法を計算しました。
Cells were tracked and both cell speed and change of fluorescence intensity were calculated using a motion analysis application (BZ-H4K, KEYENCE, Osaka, Japan) within the BZ-X Analyzer software (BZ-H4A, KEYENCE, Osaka, Japan).
